Unit Proteomics dan Metabolomics
Misi
Untuk menyediakan kepakaran intelektual dan teknikal, dan instrumentasi (platform berasaskan Spektrometri Massa), untuk analisis multipleks protein dan metabolit ke arah pembaikan tanaman. Yang penting, untuk mencapai misi ini, Unit berinteraksi rapat dengan disiplin penyelidikan lain untuk mempromosikan dan memudahkan penyelidikan translasi dan kumpulan penyelidikan berpengalaman dalam pemprosesan data dan perlombongan data.
Bidang Penyelidikan Strategik
Pembangunan kaedah untuk pemprofilan proteomik dan metabolomik daripada sifat penting/bahan penanaman masa hadapan
Pengesanan protein dan metabolit ke arah biomarker untuk hasil unggul, kualiti minyak, minyak khusus dan penyakit kelapa sawit
Kajian kebolehkesanan geografi dan ketulenan minyak sawit untuk menyokong QC industri, terutamanya berkenaan dengan kemampanan, dan
Pembinaan semula metabolik dan pemetaan data proteomik dan metabolomik.
Kumpulan Metabolomik
Metabolomik, sebagai pendekatan yang menjanjikan untuk penyelidikan translasi akan menjadi bidang tumpuan utama di bawah kumpulan ini. Aktiviti utama kumpulan termasuk:
Profil protein dan metabolit daripada bahan penanaman masa hadapan (cth. minyak khusus) dan penyakit Ganoderma
Pembangunan teknologi utama yang inovatif untuk pasaran minyak tumbuhan untuk menyokong kebolehkesanan geografi dan kemampanan kelapa sawit
Pembangunan dan penghalusan kualiti data metabolomik, analisis statistik dan Pangkalan Data Metabolom Kelapa Sawit (OPDMB)
Kumpulan Proteomik
Proteomik dan tafsiran berfungsi menggunakan alat pembelajaran IT termaju akan menjadi bidang tumpuan utama kumpulan;
Pembangunan atlas ekspresi khusus tisu dan peta proteom dengan menghubungkan set data daripada pemprofilan protein kelapa sawit dengan ciri yang dikehendaki seperti hasil unggul, kualiti minyak dan toleransi Ganoderma kepada set data gen dan transkrip yang berkaitan;
Pembangunan saluran paip analisis data omics menggunakan pelbagai kaedah termasuk analisis multivariate, penyelesaian pembelajaran mesin, pemodelan matematik dan analisis rangkaian
Pengenalpastian rangkaian metabolit kritikal dan laluan peranan penting dalam peraturan metabolik ciri-ciri tertentu.
Pengenalpastian Protein dengan Spektrometri Jisim MALDI-TOF/TOF
Kami menawarkan untuk mengenal pasti protein anda melalui analisis spektrometri jisim peptida menggunakan spektrometer jisim Laser Desorption/Ionization-Time-of-Flight (Bruker Ultraflex III) yang dibantu oleh Matriks, diikuti dengan carian pangkalan data dengan perisian pengurusan data Bruker ProteinScape.
Biasanya, selepas pemisahan protein pada gel polyacrylamide (1D atau 2D), kami akan melakukan pencernaan tryptic pada protein untuk analisis peptida. Senarai puncak yang dihasilkan kemudiannya dicari terhadap pangkalan data jujukan protein awam seperti NCBI atau SWISSPROT. Perkhidmatan kami adalah perkhidmatan berbayar tetapi teknologi dan kepakaran yang ditawarkan juga boleh dicapai melalui kerjasama.
Tawaran perkhidmatan kami termasuk, tetapi tidak terhad kepada;
Pemisahan protein berasaskan gel elektroforesis
Pencernaan enzimatik dengan tripsin
Pembersihan peptida
Pengenalpastian protein standard
Perkhidmatan tersuai (latihan, amali, reka bentuk projek dan perundingan)
MOHON SEKARANG!
Gel 1D sehingga 10 telaga – Coomassie diwarnai
Penyediaan sampel, run gel, pewarnaan dengan Comassie, tangkapan imej dengan pengimbas
Pencernaan dalam gel
Untuk memasukkan pengurangan dan alkilasi; pembersihan peptida
Pencernaan Insolution
Untuk memasukkan pengurangan dan alkilasi; pembersihan peptida
Pengenalan asas protein
MS dan MS/MS pemerolehan data, carian pangkalan data dan laporan
Aliran kerja
| Siasatan/Perbincangan | Dapatkan sebut harga | Lengkapkan borang Perkhidmatan | Perkhidmatan bermula
Laporan |
Pegawai yang boleh dihubungi
Jika anda memerlukan maklumat lanjut, sila berbincang dengan kami.
| Dr. Abrizah Othman Ketua Kumpulan Kumpulan Metabolomics |
Dr. Benjamin Lau Yii Chung Ketua Kumpulan Kumpulan Proteomics |
FAQs
- What do we do?
- How much protein is required?
- What volume is required?
- What species can be searched?
- How do I view the data?
- Can you do sample enrichments?
- What is your turn around time?
- What is the analysis cost?
- How do I ship the samples?
- Return of sample?
- Do I still pay for negative results?
- When to acknowledge the PROMET facility?
Gas Chromatography Time-of-Flight Mass Spectrometer
Sistem GC/Q-TOF MS yang terdiri daripada Gerstel 1.4.6.5 Autosampler, 7890B Agilent Gas Chromatography dan 7200B Agilent Time-of-Flight MS.
Pemindahan Perkhidmatan
MPOB TS No 167, Julai 2017
Pengenalpastian Kandungan Daun Metabolom untuk Pembangunan Varieti Baru
Borang Permohonan Kakitangan MPOB
Harga
| No | Services | Charges per injection (excluding 6% GST) |
|
|---|---|---|---|
| Academic | Industry | ||
| 1 | Analisis metabolit dengan derivatisasi N-metil-N-(trimethylsilyl)trifluoroacetamide (MSTFA) | RM 200.00 | RM 250.00 |
| 2 | Ruang kepala dinamik (DHS) /ruang kepala untuk analisis sebatian organik meruap (VOC) | RM 150.00 | RM 200.00 |
Pegawai yang boleh dihubungi
Jika anda memerlukan maklumat lanjut, sila hubungi pegawai kami
| DR. ABRIZAH OTHMAN
Ketua Kumpulan Kumpulan Metabolomics |
MDM. NURUL LIYANA ROZALI
Pegawai Penyelidik Kumpulan Metabolomics |
FAQs
- I want to analyze a sample with GC/Q-TOF. What is the concentration needed for metabolite analysis with MSTFA derivatization?
- How to prepare samples for metabolite analysis with MSTFA derivatization?
- How long will it takes to run the samples?
- How will PROMET present the reports?
- What is the size of the data file?
- How long will the data be kept?
- What guidelines apply to authorship and acknowledgements?
